Dýpkunarskip er verkfræðiskip sem notað er til að dýpka ár, hafnir, vötn og önnur vatnshlot. Það hreinsar eða stækkar vatnaleiðir fyrst og fremst með því að grafa upp, soga inn og flytja silt. Vinnureglu þess má skipta í eftirfarandi skref:
Uppgröftur og sog: Dýpkunarvélar eru venjulega búnar uppgraftarverkfærum (svo sem skeri, fötum eða soghausum), sem hrista og brjóta upp moldina neðst í vatninu með snúningi eða fram og aftur hreyfingu. Í kjölfarið sogar öflugt dælukerfi blöndu af silti og vatni (þ.e. slurry) inn í leiðslu.
Flutningur á gróðurlausn: Sýran sem sogast inn er- flutt á tiltekinn stað í gegnum leiðslukerfi. Leiðslan getur verið fljótandi eða föst, allt eftir rekstrarumhverfi og fjarlægð. Meðan á flutningi stendur þarf að stjórna flæðihraða og styrk gruggleysis innan hæfilegs bils til að tryggja skilvirkan flutning (venjulega rennsli 3-5 m/s og styrkur um það bil 20-30%).
Aðskilnaður og losun: Eftir að grisjan hefur verið flutt á áfangastað getur verið nauðsynlegt að aðskilja siltið frá vatni. Aðskilnaðarbúnaður (eins og vatnshringir eða botnfallsgeymar) skilur set frá vatni. Setið er hægt að nota til urðunar eða birgðasöfnunar á meðan hægt er að endurvinna vatnið eða losa það aftur í vatnshlotið.